邮箱:chenyang1816185048@bjmu.edu.cn
地址:北京市昌平区北大医疗产业园12号楼1层
个人简介:
2024-至今 副研究员(Tenure track):北京大学临床医学高等研究院精准医疗多组学中心/基础医学院
2018—2023 副研究员(Tenure track):精准医疗多组学中心/基础医学院
2016—2018 副研究员:清华大学生命科学学院
2014—2016 助理研究员:清华大学生命科学学院
2012—2014 博士后:清华大学生命科学学院(合作导师:俞立)
2008—2012 博士:北京大学医学部基础医学专业(美国国立卫生研究院)(导师:柯杨、Matthias Machner)
2004—2008 本科:北京大学医学部基础医学专业
2021年-至今 中国细胞生物学学会细胞器分会秘书长
主要研究方向:
主要研究方向为膜性细胞器发生和基于质谱的蛋白组学方法开发和应用。
研究方向1:
主要关注外泌体、新细胞器迁移体等细胞外囊泡发生、物质分选运输、细胞间信号沟通的分子细胞生物学机制。
该研究阐述了“新细胞结构“迁移体内”新的纳米囊泡“的性质和运输途径,研究发现Rab10和Caveolin-1 (CAV1)标记了迁移体内的纳米囊泡,囊泡转运到迁移体需要动力蛋白Myosin Va和接头蛋白RILPL2。LRRK2激酶对Rab10的磷酸化调节了转运过程。功能蛋白CSF-1通过这一途径释放,在皮肤创面愈合过程中促进单核-巨噬细胞分化。该研究揭示了细胞通过迁移体进行蛋白质分选和细胞外释放的机制,从而促进了我们对迁移体的功能作用及其对细胞间通讯的影响的理解,成功于2024年发表于PNAS。
图1. 迁移体内纳米囊泡的运输途径。
研究方向2:
应用蛋白质谱技术大规模地发掘基于疾病问题和临床队列的生物标志物,探索疾病发生规律。
该研究开发了一种新的深度蛋白质组学分析方法,用于体液样本细胞外囊泡(EVs)的蛋白质组分析。该方法具有更高的鉴定深度,能够在血液样本单次分析中鉴定超5000个蛋白质,高重现性和可重复性,简化的工作流程,适用于大规模队列研究,并兼容有效的验证体系。该方法为蛋白质组学研究提供了新工具,有助于推动生物标志物的发现和疾病机制的深入理解,该方法于2024年发表在Communications Biology 。
图2. 血浆细胞外囊泡LEV和SEV组分与常规血浆低丰度(LA)蛋白组鉴定深度、动态分布和细胞内定位分析。
代表性科研项目:
科技部脑计划青年项目(2022-2026,参与,100万元)
国家重点研发计划重点专项(2023-2026,课题骨干,70万元)
国家自然科学基金委青年项目(2024-2026,主持,30万元)
10篇代表性论文:
Congyi Yang*, Jingyi Chen, Yuzheng zhao1, Jushan Wu1, Yalan Xu1, Jun Xu1, Feng Chen#, Yang Chen#, Ning Chen#. Salivary exosomes exacerbate colitis by bridging the oral cavity and intestine. iScience. Accepted in principle.
Yong Li*, Yiling Wen*, Ying Li, Xinyi Tan, Shuaixin Gao, Peiyao Fan, Wenmin Tian, Catherine CL Wong#, Yang Chen#. Rab10-CAV1 mediated intraluminal vesicles transport to migrasomes. PNAS. 2024 Jul 23;121(30);
Wenmin Tian*, DongXue Shi*, Yinmei Zhang*, Hongli Wang, Haohao Tang, Zhongyu Han, Catherine CL Wong, Liyan Cui#, Jiajia Zheng#, Yang Chen#. Deep proteomic analysis of obstetric antiphospholipid syndrome by DIA-MS of large and small circulating extracellular vesicle enriched fraction. Communications Biology. 2024 Jan 15;7(1):99.
Yinmei Zhang*, Shangjia Jin*, Wenmin Tian*, Dongxue Shi, Yang Chen#, Liyan Cui#, Jiajia Zheng#. Proteomic of serum samples for the exploration of the pathological mechanism of Obstetric Antiphospholipid Syndrome. Journal of Proteome Research. 2024 Jan 5;23(1):289-300. Selected Cover.
Yang Chen*, Nan Zhang*, Jie Zhang*, Jiangtao Guo*, Shaobo Dong*,Heqiang Sun, Shuaixin Gao, Tingting Zhou, Min Li, Xueyuan Liu, Yaxin Guo, Beiwei Ye, Yingze Zhao, Tongqi Yu, Jianbo Zhan, Yongzhong Jiang,Catherine CL Wong#, George F. Gao#, William J. Liu#. Immune response pattern across the asymptomatic, symptomatic and convalescent periods of COVID-19. Biochimica et Biophhysica Acta proteins and proteomics. 2022 Feb 1; 1870(2): 140736. Epub ahead of print. (Cover story)
Wenmin Tian*, Delin Li*, Nan Zhang*, Guijie Bai, Kai Yuan, Haixia Xiao, Feng Gao, Yang Chen#, Catherine C L Wong#, George Fu Gao#. O-glycosylation pattern of the SARS-CoV-2 spike protein reveals an "O-Follow-N" rule. Cell Research. 2021 Oct;31(10):1123-1125.
Yang Chen*, Hangping Yao*, Nan Zhang*, Jie Wu*, Shuaixin Gao, Jiangtao Guo, Xiangyun Lu, Linfang Cheng, Rui Luo, Xue Liang, Catherine CL Wong#, Min Zheng#. Proteomic analysis identifies prolonged disturbances in pathways related to cholesterol metabolism and myocardium function in the COVID-19 recovery stage. Journal of Proteome Research. 2021 Jul 2;20(7):3463-3474
Wenmin Tian*, Nan Zhang*, Ronghua Jin*, Yingmei Feng*, Siyuan Wang*, Shuaixin Gao, Ruqin Gao, Guizhen Wu, Wenjie Tan*, Yang Chen#, George, Fu Gao#, and Catherine CL Wong#(corresponding author). Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. Nature Communications. 2020, 11(1):5859.
Puzhong Lu, Rui Liu, Di Lu, Yue Xu, Xueyi Yang, Zheng Jiang, Chun Yang, Li Yu#, Xiaoguang Lei#, Yang Chen# (2020). Chemical screening identifies ROCK1 as a regulator of migrasome formation. Cell Discovery, 2020 Aug 4;6:51.
Xiaoxin Zhao*,Yaxin Lei, Jiajia Zheng, Junya Peng, Ying Li, Li Yu#, and Yang Chen# (2019). Identification of markers for migrasome detection. Cell Discovery, 2019 May 21;5:27. (co-corresponding author)